לא היית צריך לזרוק לפח, אלא לעשות לדיסק md5sum ולבדוק את תקינות המידע שעליו. ד"א, למיטב ידיעתי - היה באג ב-boot של ג'נטו 2005.1, אז אולי הבאג הזה הופיע אצלך. לא התעדכנתי לבדוק אם הוא תוקן.