אבל אף אחד לא יודע מה היה המקור של הנינג'ה, היה ריגול עוד לפני שהיו נינג'ה. השם נינג'ה ניתן מאוחר יותר ואז הטכניקות כבר היו קיימות. נינג'ה באו ממקורות שונים, חלקם סמוראים, חלקם נזירים לוחמים, חלקם פליטים מסין. פשוט להגיד שהנינג'וטסו בא מהנינג'ה והג'וג'וטסו מהסמוראים נשמע לא מדויק. הסמוראים התפתחו מהלוחמים ביפן http://en.wikipedia.org/wiki/Samurai מן הסתם הם גם למדו את הטכניקות השונות ללחימה. אז הם כנראה אלה שהשתמשו גם בג'וג'וטסו אבל אולי הם לא היחידים. אולי גם הנזירים הלוחמים השתמשו בהם. הנה רשימה של תחומי הסגנונות
Battojutsu & Iaijutsu techniques of sword-drawing; sword-drawing art Bojutsu & Jojutsu techniques of staff & stick; staff or stick art Jujutsu & Kogusoku techniques of flexibility; grappling art Kenjutsu techniques of the sword; swordsmanship Naginatajutsu techniques of the glaive; glaive art Other weapons of the bushi chain-and-sickle, truncheon, etc Sojutsu techniques of the spear; spear art מתוך:
http://www.koryu.com/guide/ryuguide.html#ryutype
אפשר לראות שיש המון שיטות, שהשתמשו בהם סמוראים, לא רק ג'וג'וטסו. אבל לנו במערב קל יותר לעשות את החלוקה הדיכוטומית הזו לטוב-רע, סמוראי-נינג'ה, ג'וג'וטסו-נינג'וטסו. החיים במזרח הם לא שחור ולבן...