בנושאים מסויימים דומה שהסטטוס קוו המקורי לא עודכן או לא פורש נכון בהמשך.
למשל, בן גוריון הסכים לפטור כמה מאות בחורי ישיבה משירות בצבא מתוך הסכמה שלמען שיקום עולם התורה ושימור ערך לימוד התורה ראוי שמספר מצומצם של עילויים ומתמידים יתרכזו בלימוד תורה בלבד. כשמספר בני הישיבות גדל מאוד גם אבסולוטית וגם יחסית לכלל הציבור, אותה הסכמה איבדה ממשמעותה המקורית. הסטטוס קוו המשיך טכנית בלבד.
כנ"ל לגבי ההחמרות השונות שהתפתחו בעולם הדתי לאורך השנים. צה"ל היה מחויב לפי הסטטוס קוו לשמור על מסגרת יהודית מסויימת (כשרות, שמירת שבת וכו') אבל ההקצנה גרמה לכך שבפועל נוספו דרישות חדשות שלא היו קיימות בזמן שנקבע הסטטוס קוו (כולל, עניין שירת הנשים).
גם בעניין "מיהו יהודי", דומני (אבל בכך אינני בקי) שעניין ה"גיור כהלכה" בחוק עלה רק עשרות שנים אחרי שנחקק חוק השבות ושלפני כן לא הקפידו בעניין.