מזכיר הממשלה עובד יחזקאל אמר בתגובה, כי "הממשלה מתייחסת לדו"ח ברצינות רבה. חלק מהתהליכים לוקחים זמן, לעיתים אף יותר משחשבנו. גובש נוהל להפעלת הקבינט המדיני בטחוני, עבדנו עליו חצי שנה ואני מקווה שתוך שבועיים הוא יסתיים. דו"ח וינוגרד עבורנו הוא כמו החלטות ממשלה".